A guerra reduziu o Japão a zero, e o Godzilla mergulhou-o no negativo. Passaram-se dois anos desde então, e o país tem enfrentado lutas agonizantes para alcançar a recuperação e, finalmente, voltar à vida normal. No momento em que a humanidade conseguiu se agarrar a uma paz conquistada com dificuldade, surge uma nova ameaça, esmagando a esperança num instante.