Em um futuro próximo, um meteorito carregando um vírus alienígena cai no Japão, causando uma infecção devastadora em todo o país e levando a sociedade ao caos total. Anos depois, Shu, um adolescente com uma habilidade especial despertada pelo Vírus do Apocalipse, conhece uma garota misteriosa que o incentiva a lutar contra forças robóticas de uma organização governamental e de uma sociedade secreta, cujos verdadeiros objetivos permanecem envoltos em mistério.